WeChat_26BF6A WeChat_26BF6A - 青春版的记忆。 全基因组测序

微基因测序青春版报告内容很丰富

下载了测定的核心数据和报告全文,花费24小时左右。报告内容很丰富,关于个人基因的对疾病好坏的预测,很有参考价值,感觉心里敞亮了。因为测的基因多,故测定父系基因的深度好像不是很深,但已经不错了。当然测定的基因数目量大是更重要的现实问题。本人是外行,对祖源感兴趣。与周围标杆人的基因进行比较(本测定方法在检测时基本上排除了自己祖源朝鲜族的影响),可知与他们远近距离,获得了更客观的信息,我觉得很有趣味。每个人都有2-10万个基因,它们的数目都应该是相同,只是表达的会有差异些,只不过有的显性容易测定,有的不易检测,希望科技能越来越进步,当然不会像想的那样容易。母系和父系都对祖源有重要影响,没想到有分散聚类的点位,通过拟合计算出来了。
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2021-10-22 • 黑龙江省, 中国 • 发自微基因APP
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14 个回复

元月十号 - 【杜】o-cts4960/外公【崔】T1a3b2a1b/外婆【张】O2a1c1a1a1a1g
确实挺有趣味的,微基因的WGS还是很超值的
鬼王 - 主角们从不回头看爆炸
不仅可以在微基因得到比几百元版更详细的解读,感兴趣的话您也可以将数据转化并上传在其他平台作进一步分析,以及自学tablet、samtools等分析全序数据用的工具
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根据楼主的K12b拟合的遗传距离和常染结果
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基因检测实验是针对基因的,不会知道碱基对的排列顺序。测定人体中46个单倍体的DNA中碱基对(30亿个)排列顺序的实验(对个人意义不大)是非常复杂麻烦的。每个人的每个基因中碱基对顺序是不同的,差异不大(搜索的论文资料估计在0.01%-0.1%之间)。人的基因数在3.2万个左右,如不考虑基因拷贝数即重复数cnp等复杂情况的影响,每个基因平均应该有9.375万个碱基对(实际要少些),因此不同基因中的snp数(单核苷酸多态性)在10-94个左右。根据实验结果,估算cnp数和基因数在未来应该不是很难。
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world 22计算器的结果(GenotypeRate: 0.717):Pygmy: 0.106;West-Asian: 0.001;North-European-Mesolithic: 0.001;Indo-Tibetan: 0.001;Mesoamerican: 0.816;Arctic-Amerind: 0.001;South-America-Amerind: 0.001;Indian: 0.001;North-Siberean: 0.136;Atlantic-Mediterranean-Neolithic: 0.001;Samoedic: 0.001;Indo-Iranian:0.001;East-Siberean: 29.083;North-East-European: 0.001;South-African: 0.001;North-Amerind: 0.001;Sub-Saharian: 0.001;East-South-Asian: 68.898;Near_East: 0.001;Melanesian: 0.001;Paleo-Siberian: 0.945;Austronesian: 0.001。与k13、k7b、world9计算器综合的结果有些相似,保持了清晰明确的结果,但检测范围大。
 
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WeChat_A70B9B - 哈哈哈
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根据个体的基因检测的核心数据结果与第三方筛选的祖源进行比对解读(其他计算器的解读都有一定的参考价值与可取之处)。
 
E11的计算结果:  非洲:0.001%,欧洲:0.001%,印度:0.001%,马来:0.001%,傣族:4.21%,彝族:11.5%,华东:37.9%,日本:28.1%,中国北部鄂伦春:14.3%,雅库特:3.49%,美洲:0.551%。
K7b的计算结果:  南亚:0.001%,西亚:0.072%,西伯利亚:27.1%,非洲:0.001%,南欧+中东一带:0.001%,大西洋波罗的海:0.001%,东亚:72.8%。
K12b的计算结果:  格德罗西亚:0.001%,西伯利亚:6.73%,西北非:0.001%,东南亚:16.9%,大西洋地中海:0.001%,北欧:0.001%,南亚:0.001%,东非:0.001%,西南亚:0.001%,东亚:76.3%,高加索:0.001%,南撒哈拉:0.001%。
K13的计算结果:  西伯利亚:28.7%,美国印第安人:0.001%,西非:0.001%,古非洲:0.001%,西南亚:0.001%,东亚:70.4%,地中海:0.001%,澳大利亚:0.425%,北极:0.45%,西亚:0.001%,北欧:0.001%,南亚:0.001%,东非:0.001%。
K47的计算结果:  东亚:42.489%,中国南方人:21.639%,通古斯语族群:20.398%,蒙古人:9.960%,原始南岛语族群:2.942%,藏缅族群:2.413%,亚马逊人:0.118%,地中海:0.001%,帕米尔人:0.001%,西地中海:0.001%,巴布亚人:0.001%,中美印第安人:0.001%,马来人:0.001%,波罗的海:0.001%,非洲南部游猎民族:0.001%,伊朗人:0.001%,北欧族群:0.001%,非洲东部游猎民族:0.001%,西北印度人:0.001%,萨赫勒人:0.001%,乌拉尔语族群0.001%,西芬兰人:0.001%,西非:0.001%,凯尔特人:0.001%,北海日耳曼人:0.001%,西伯利亚人:0.001%,楚瓦什人:0.001%,东北亚(应该是非通古斯语族群和蒙古人):0.001%,南印度人:0.001%,中南半岛人:0.001%,安第斯山人:0.001%,非洲中部游猎民族:0.001%,东欧:0.001%,阿拉伯人:0.001%,北美印第安人:0.001%,蒙达语族群:0.001%,奥摩语族群:0.001%,地中海东部:0.001%,尼罗河流域语族群:0.001%,阿尔泰人:0.001%,古巴尔干人:0.001%,北高加索人:0.001%,南高加索人:0.001%,北非:0.001%,东伊比利亚人:0.001%,北伊比利亚人:0.001%,库希特语族:0.001%。
K35的计算结果:  东亚(日韩):11.9228%,东亚(核心):11.2733%,东北亚:10.3600%,台湾原住民:10.2145%,东南亚:9.6471%,恩家那桑:8.9513%,缅甸泰国:7.4338%,东西伯利亚:6.7967%,中北亚:6.7201%,中南美:4.5813%,南美:4.5362%,俄南:3.2307%,海岛:1.3761%,HAZARA_UYGUR_UZBEK:1.3722%,孟加拉:0.7112%,南亚:0.3297%,古吉拉特_帕托:0.2075%,古吉拉特:0.1552%,PATHAN-SINDHI-BURUSHO:0.1244%,卡拉什:0.0549%,BALOCHI-MAKRANI-BRAHUI:0.0010%,南非:0.0000%,撒丁岛:0.0000%,中非:0.0000%,土耳其-伊朗-高加索:0.0000%,东北欧:0.0000%,肯尼亚班图:0.0000%,近东:0.0000%,孟德人:0.0000%,北欧:0.0000%,北非:0.0000%,意大利:0.0000%。
world的计算结果:  美国印第安人:0.001%,东亚:75.3%,非洲:0.001%,大西洋波罗的海:0.001%,澳大拉西亚:0.136%,西伯利亚:24.6%,高加索_格德罗西亚:0.001%,南欧+中东一带:0.042%,南亚:0.001%。

 
有测友商的吗?
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细菌的pc值分散图中的pc值是细菌颗粒大小的聚类有关。基因检测时的pc值应该是与DNA的颗粒大小、snp变异等聚类有关的实验值。至于其它的实验值如E等不一定与DNA或snp变异的聚类有关。
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微基因、23魔方、E11、K12b计算器能明显区分JPT和KOR等。微基因和23魔方选择方法得到了国人的较高的认可,其它有趣的计算器好像不接地气。而K7b、K13、world9计算器区分不开JPT和KOR等,主要是没有选择三种以上保持一定距离的相近成分。K47和K35的区分效果不好,可能是标杆人的选择没有保持好一定的距离。
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好像不能区分中日的计算器非常少。

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