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我的报告有疑问!!!

父系祖源:O1b1a2a1
得出的应该是F779。
有网友说我的报告有问题,应该得不出 F779。
对话如下:

网友:F779明明是负数

我:那我的是父系: O1b1a2a1  对照isogg和yfull得出 F779 啊?

网友:芯片有问题

网友:F779-,F4070-,F3262-。应该都是正,如果是F779的话

网友:你的报告都是负数

网友:但得出结论是F779肯定有问题啊

网友:你问他们吧

我:好的,我去问问。
2016-09-13 • IP属地苏州
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10 个回复

田园牧歌 - 追本溯源 · 微基因
首先要理解什么是SNP~ SNP指的是基因组里面一个可能出现变异的位点(比如说F779)。单倍体是根据分析人类的基因而总结出来的一些“分支”,这些分支是根据某些SNP的变异而界定的(比如说O1b1a2a1)。因此,随着越来越多人参加基因测试项目,科学家通过对比分析就会发现更多的SNP,可能出现树图的分支有改变(比如说发现新分支)。微基因所得出的O1b1a2a1单倍体是以ISOGG发布的单倍体树图为标准。ISOGG是国际遗传基因协会,它们公布的单倍体划分被广泛使用(每年都有更新,所以分支的称呼也会出现改变的)。你所说的F799是另外一个组织Yfull用来识别O1b1a2a1分支的SNP位点而已,不是说你有或没有这个SNP变异就会变得不属于O1b1a2a1了。微基因只不过是根据另外一个标准的另外一组SNP来识别这个单倍体(分支)。
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是F779,那我的支系还有别的吗?
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@wang @金刚石 @蓝星旗@dzau @chengang @所有大神 给我分析分析,是网友分析的有问题吗?
费力科思 - WeGene勤杂工
我检查一下,谢谢反馈
yaoxt - WeGene生信+遗传咨询师
我门目前是以ISOGG的版本为参考的,目前用的Y SNP tree里,只有F3262在我们的list里面,F779和F4070都没有在ISOGG这个版本的树中。所以您的父系祖源结果,应该是因为O1b1a2a1下面其他的位点匹配到而得出的结果。在y 树上鼠标移动到节点可以看到所有匹配上的位点(蓝色),我们最近把位点名字也标注上了,您可以看看具体的匹配情况。
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@yaoxt:这个蓝色的还不是对应 F779 ?
20160913165244.png


QQ截图20160913165144.jpg


QQ截图20160913165202.jpg
yaoxt - WeGene生信+遗传咨询师
ISOGG的O1b1a2a1跟YFull的F779应该是等同的,但两者定义这个haplogroup的SNP是不同的。
ISOGG用的是这些:F1759, CTS5847, CTS8414, CTS11890, F2064, F3314, F3323, F3346, F3478, Z24393, Z24407

Yfull用的是这些:F2064 * CTS12981 * F779 F3314 * F2862 * F3217 * CTS10702 * CTS2976 * CTS8414 * F3346 * CTS5847 * CTS8039 * CTS9891 * F2383 * F2414 * CTS3707 * CTS4112 * F2124 * CTS11179 * CTS11890 * CTS2899 * CTS4485 * F1822/CTS3165 * CTS5445 * CTS6421 * F1484 * F3262 * F993 * CTS10154 * CTS10437 * F2590 * F3323 * CTS11033 * CTS9377 * CTS9574 * F2120 * F2131 * CTS8849 * F2771 * CTS2181 * F3135 * CTS7387 * CTS10677 * F1669 * CTS10406 * CTS2965 * CTS5188 * F1759 * CTS11437 * CTS4936 * F4128 * CTS11699 * F4070 * F4130 * F2872/CTS9364 * F3478 * CTS6920 * Z24381/CTS3094/PF2050

ISOGG跟Yfull所采用的SNP有7个重叠。

WeGene是根据ISOGG的标准来做的。ISOGG在这个haplogroup上有11个SNP,其中有6个SNP在WeGene的芯片。根据您的授权,我们查看了你的结果,这6个SNP是全部匹配O1b1a2a1的。所以,我们根据ISOGG的标准判断你的Y Haplogroup是O1b1a2a1。

您提到的F799 SNP并不在ISOGG标准中,也不在我们的检测芯片上。
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
F779不是唯一决定这一支系的SNP位点
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
6383526 F779 A->G
7554377 F993 C->T
8907922 F4128 C->A
9098026 F4130 G->A
9104128 F1484 G->T
14001359 F1669 C->T
15989850 F2064 A->T
16285699 F2120 G->A
16330010 F2131 T->C
17111599 F2383 T->G
17188767 F2414 T->C
17767448 F2590 G->A
18553194 F2771 C->T
18835772 F2862 C->T
19400994 F3036 T->A
21618591 F3217 G->A
21837946 F3262 A->G
22550485 F3314 C->T
22587335 F3323 C->T
22698467 F3346 A->G
23573679 F3478 C->T
26134908 F3679 C->G
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
你的分型是准确的,这个网友不太懂Y染色体谱系,误会了WeGene

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