xiaofeng281949 xiaofeng281949 父系单倍群N

【请教大神】看到一份最新的关于单倍群N分类的研究报告,值得参考,但是不知道怎么用于分析自己的数据并归类

文章来源 https://arxiv.org/abs/1504.06463
 
似乎介绍了一种全新的N单倍群分类的方式。然而这里有很多SNP不知道WeGene里是不是有分析到,是否可以用来判断自己在新的分类体系里属于多少。只有请教大神啦!!
2016-10-06 • IP属地中国
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10 个回复

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
我是这篇论文的作者之一
 
WeGene芯片涵盖了论文中提到的SNP,你只需要到自己的祖源结果页面,点击beta树,看上面的突变位点情况即可。
wegene藏龙卧虎啊,哈哈。

谢谢@wang的答复。我的问题在于我好像无法根据那篇文章里的分类方法把我归类。不知道是不是我弄错了。贴上我的突变位点。请指教一下吧。
 
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
你是P43+啊,因为论文中没有检测L665这个位点,所以你在Figure Legend中找不到自己L665+的分类。
噢, 看起来我只有M231和P43两个位点match。科室貌似从M231到P43之间还有两个位点我是没有的,是不是?F1206, F2130, F3094, F3312, F3361, F3163, F3665, 这些我都没有啊。
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
注意:WeGene展示的beta树是根据现有ISOGG的树http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpN.html来画的拓扑结构,而genotype的位点却多于现有ISOGG的N树,所以没有展示出的位点就要去你的原始数据里去查找了。
嗯,嗯, 了解,谢谢@wang. 我现在的原始数据还没有出来。还不知道怎么在原始数据里找位点,有没有什么攻略介绍我可以先研究研究的呢?
 
另外,我查阅了一些资料,N单倍群大概是在公元前4000年的时候逐渐被O单倍群取代成为东北亚的优势族群。有没有可能所谓涿鹿之战就发生在古老的N单倍群和O单倍群之间?然后这场战争酝酿出了龙山文化?
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
不清楚N和O与逐鹿之战的关系
我是瞎猜的啦。。
 
我现在的原始数据还没有出来。还不知道怎么在原始数据里找位点,有没有什么攻略介绍我可以先研究研究的呢?
@wang, 我的最终数据出来了。在数据里找到了匹配的SNP如下:
 
Common N:
M231
M232
F2636
F3373
F963
F2999
 
N2:
F2952
F2930

N2b:
F2569

P43 ??
 
按照这里的描述,大概属于N2b。不过奇怪的是我也有P43这个SNP。是不是N2的分类还可以再细化?谢谢.
 
PS: 按照这里的分法,应该我属于N F4201。
我只有F3665+ f1774+ f2729+ v2047+。

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