guwei0001 guwei0001 祖源分析

常染色体admixture分析

wegene的常染分析是直接给出K值最大时(假如K=20)的结果,分得比较细。但是分得太细比较难解读。
建议wegene能给出K=2\K=3\K=5等k值从小到大的结果,就像admixture分析那样。
admixture分析就可以给出k值从小到大逐步细分的结果,这会好解读一些。也可以看到各地人的南北、东西比例等。
比如:
K=2, 得出南、北血统比例
k=3, 得出北、东、西血统的比例
。。。。。。。依次类推。
而且会有多个汉族人和其他民族的对比,表示在一张图上。
这次有个网友愿意帮忙做admixture分析,愿意的网友可以给我发邮件:guwei0001@hotmail.com, 我这边转发给他。
时间到10月28号为限。23andme和WEGENE的数据都可以。请注明地方和民族。
声明:这不是广告!对南、北血统比例等感兴趣的可以加入,并邮件联系。
2016-10-23 • IP属地中国
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4 个回复

费力科思 - WeGene勤杂工
我们很快会放出开源的R软件包,让有兴趣的用户自己折腾。
 
如果没有好的参考数据集,光是修改K的数值,并不能得到你所介绍的结果,比如北,东,西~~~
回答wang:
网上有网友愿意做常染色体admixture分析,有常染数据的可以加入一起跑一次。纯属玩票,不是商业行为,可能就做这一次。
radmixture是不是也有类似的功能?
好主意

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