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祖源分析中,小数点如果保留三位小数的话?

看了祖源分析,很多人的0.00%的数值但名称排序不同,因为wegene是按照比例排序的,看起来显然是有数值的,只是小于0.005而已,能不能给显示三位小数出来?

另一个问题,人只有46条染色体,祖源成分为何不是1/46的整数倍?
2016-12-22 • IP属地中国
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2 个回复

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
Hi
 
祖源比例是一个基于模型的模拟过程,本身的误差就不止三位小数,所以三位小数没有任何意义,反而会造成误导;
 
祖源比例是基于SNP位点而不是基于染色体来算的,我们的基因组里有46条染色体但是有30亿个碱基对呀。。。    祖源分析是一个比较的过程,将你的数据和不同人群的进行比较来看你和哪些人群最相近、你可以模拟成由哪些人群按何种比例混合而成的等。主要是根据遗传位点在人群中的频率分布,简单来讲就是A位点的某分型在A人群中高频出现,而在其他人群中是没有的或极低频的,那我们就可以把A位点的这个分型认为是A人群的特征性位点。推算完这些位点的归属人群,那么我们只要数一数你基因组上的不同类别的遗传位点的数目就大致得出了你的祖源成分。
hum
1.三位小数点完全没有意义,误差至少在1%左右(言下之意,1%以下的祖源成分基本可以意义忽略)。
2.染色体可以发生部分交换,你的每条染色体的不同区段都是很多个人的染色体反复多次交换后的结果。所以不是以染色体为单位计算的。另外不同染色体大小差别非常大,信息含量并不一样。

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