
O2a2b1a1a1a1a(F813, Y21364)的假等价位点和测试的假阳性位点问题
我的父系测试结果是O2a2b1a1a1a1a,按照ISOGG2018的定义,这个单倍群有两个等价位点:F813/M6539, Y21364
当然啦,我们知道,真正的等价位点几乎不存在,实际上是因为测试样本过少,没有找到一部分阳性,另外一部分阴性的位点,不然还可以中途分叉。或者分叉的支系绝嗣了,这种情况下才能视作完全的等价位点。
我的O2a2b1a1a1a1a测试位点仅有Y21364+点亮,F813/M6539是阴性,难道我就是那个中途的分叉单倍群?
再看上游的O2a2b1a1a1a1,这个单倍群由30个等价位点定义,其中2个达不到质量标准,wegene实际测试了20个位点,可能是为了降低成本。但我仍然发现有两个位点是阴性:Y21367-,Y21366-,难道这里至少还有一个新增分叉?
如果数据没有测试错误,那么单倍群树就应该是下图(假想的新增分叉用虚线连接),我在O2a2b1a1a1a1和O2a2b1a1a1a1a(F813+, Y21364+)之间,属于F813-, Y21364+,如下图:
无法确认有没有假阴性的位点,但我确实发现相邻的几支单倍群出现了假阳性位点,由于这些单倍群到Y根部没有路径点亮,基本可以肯定是假阳性,如下几图(包括O2a2b1a1a2a1a,O2a2b1a1a5a2,O2a2b1a1a7a):
wegene比友商还是强点,友商只测试单倍群的单个位点,误差可能较大。
当然啦,我们知道,真正的等价位点几乎不存在,实际上是因为测试样本过少,没有找到一部分阳性,另外一部分阴性的位点,不然还可以中途分叉。或者分叉的支系绝嗣了,这种情况下才能视作完全的等价位点。
我的O2a2b1a1a1a1a测试位点仅有Y21364+点亮,F813/M6539是阴性,难道我就是那个中途的分叉单倍群?
再看上游的O2a2b1a1a1a1,这个单倍群由30个等价位点定义,其中2个达不到质量标准,wegene实际测试了20个位点,可能是为了降低成本。但我仍然发现有两个位点是阴性:Y21367-,Y21366-,难道这里至少还有一个新增分叉?
如果数据没有测试错误,那么单倍群树就应该是下图(假想的新增分叉用虚线连接),我在O2a2b1a1a1a1和O2a2b1a1a1a1a(F813+, Y21364+)之间,属于F813-, Y21364+,如下图:
无法确认有没有假阴性的位点,但我确实发现相邻的几支单倍群出现了假阳性位点,由于这些单倍群到Y根部没有路径点亮,基本可以肯定是假阳性,如下几图(包括O2a2b1a1a2a1a,O2a2b1a1a5a2,O2a2b1a1a7a):
wegene比友商还是强点,友商只测试单倍群的单个位点,误差可能较大。
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