社区首页 综合讨论区 讨论详情
失落的YY1P2基因 综合讨论组

全基因组vcf数据的疑问

在微基因做了wgs，在友商也做了一次，微基因下载的只有一个vcf文件，友商给了4个vcf文件，一个sv，一个indel，一个snp，还有一个cnv。问：微基因是把这几种都合在一起了还是只给了snp和indel的结合？
2019-05-18 • IP属地上海
按热门排序    按默认排序

2 个回复

[已注销]
snp+indel的结合信息是有的，但同为用户，我不清楚有没有sv和cnv的信息

同时打开文件看了一下，最后一列没有“0/0:”的内容，估计是记录了一个人全序数据里全部400多万处有突变的位置

赞同来自:

(0)
2022-01-22 • IP属地呼和浩特 • 评论 (0) • 发自微基因APP
yhlhhhhh - 每日与生物工程斗智斗勇到谢顶
里面的东西都应该是合在一个里面了，这个我之前用Python的vcf模块输出的时候看到过

赞同来自:

(0)
2022-01-23 • IP属地北京 • 评论 (0) • 发自微基因APP

要回复问题请先登录或注册

© 2024 WeGene. All Rights Reserved
深圳市市场监督管理局企业主体身份公示 深圳市市场监督管理局企业主体身份公示  |  粤ICP备15012185号  |  互联网药品信息服务资格证书:（粤）-非经营性-2023-0379