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我原始数据中的rs1800497位点是AG，而snpedia上这个位点有CC,CT,TT，是不是弄错了？

我原始数据中的rs1800497位点是AG，而snpedia上这个位点有CC,CT,TT，是不是弄错了？
2016-12-30 • IP属地福州
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2 个回复

费力科思 - WeGene勤杂工
23andme给的raw data也全是正链的。处理方法是一样的。

赞同来自: jameszeng

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2016-12-30 • IP属地深圳 • 评论 (0)
费力科思 - WeGene勤杂工
这个位点的Orientation是minus，WeGene给的raw data里面都是plus的。所以对于Orientation是minus的位点，要取互补的碱基。
 
所以你说的这个位点的AG，对应到负链上就是CT。

赞同来自: jameszeng

(1)
2016-12-30 • IP属地深圳 • 评论 (0)

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