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TP53,rs1042522友商的解读

微基因:https://www.wegene.com/crowdsourcing/details/26
 
友商的TP53 杂合 参考序列 NM_000546.5:c.215C>G(NP_000537.3:p.Pro72Arg) 外显子 4 药物反应
 
解释
 
位于TP53基因中的错义变体。

Ara等人报道p53的P72R(脯氨酸Pro变为精氨酸Arg)变化是由多态性而非突变引起的。 Olschwang等评估了P72R多态性的频率,以及从结肠癌患者和对照组的频率。研究结果表明,它与结肠癌无关。在癌症组和对照组中,pro72和arg72等位基因的频率分别为约31%和69%。Storey等研究了P72R多态性对E6介导的降解的易感性的影响,并发现arg72比pro72形式明显更易感。此外,HPV相关患者的等位基因分析与正常人群相比,肿瘤显示出纯合的arg72 p53的过度代表性,表明个体与杂合子相比,arg72纯合子对HPV相关肿瘤发生的敏感性约为7倍。

使用免疫沉淀,然后进行SDS-PAGE,Thomas等发现arg72和pro72 p53变异在序列特异性方式结合DNA的能力没有差别。他们得出结论,arg72和pro72在构象上难以区分,两者都可以被认为是野生型。但是,托马斯等人指出p53(pro)是比p53(arg)更强的转录诱导物,而p53(arg)诱导细胞凋亡更快,并且是比p53(pro)更有效的转化抑制剂。马林等人发现一些肿瘤衍生的p53突变体结合并灭活p73(PMID 601990)。这些突变体的结合是受TP53密码子72编码的精氨酸或脯氨酸的影响。 p53结合p73,中和p73诱导的细胞凋亡的能力。当密码子72编码arg时,与EJ-Ras合作的转化细胞被增强。马林等人(2000)得出结论,p53家族成员的失活可能有助于p53突变体子集的生物学特性,并且p53内的多态性残基影响突变体行为。

喉乳头状瘤病是由人乳头瘤病毒引起的,并且在3%至7%的病例中与恶性转化有关。Aaltonen等(2001)发现一组喉癌患者P72R多态性的患病率在乳头状瘤和对照组中没有差异。

Pro72Arg多态性发生在p53的富含脯氨酸的结构域中,这是蛋白质完全诱导细胞凋亡所必需的。杜蒙等人发现在细胞系中含有编码pro72和arg72变体的等位基因的诱导型,并且在细胞系中在内源性p53中,arg72变体诱导的细胞凋亡明显优于pro72变体。他们建议至少有一个来源增强的凋亡潜力是arg72变体定位于线粒体的能力更强;这种本地化伴随着将细胞色素c释放到胞质溶胶中。在92名高加索人MLH1(120436)或MSH2(609309)突变携带者中,包括47名患有结肠直肠癌的人,Jones等人分析了p53密码子72基因型,发现arg / pro杂合子在任何年龄段内获得结肠直肠癌的可能性是1.94倍。

克鲁格等人研究了167例遗传性非息肉病性结肠癌无关的患者的p53基因型(HNPCC;见120435)在MSH2或MLH1中发生种系突变,发现arg / arg的发病年龄中位数为41岁,arg / pro为36岁,pro / pro个人32年(p小于0.0001)。 126例微卫星稳定患者的发病年龄无差异。

Bougeard等研究了MDM2 SNP309多态性和P72R多态性的影响。p53基因对61个法国携带p53种系突变的癌症风险。 p53密码子72多态性中肿瘤发病的平均年龄arg等位基因携带者(21.8岁)与pro / pro患者不同(34.4岁,p <0.05)。 Bougeard等(2006)也观察到了两种多态性的累积效应,结果证实了这一点。
 
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2019-06-14 • IP属地中国
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arg、 pro 与 CC .GG的关系是什么?

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