个人用户拿到了fq数据,请问如何转化成rs以及AGCT格式?

2015-11-27 • IP属地中国
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2 个回复

费力科思 - WeGene勤杂工
如果是全基因组数据,想使用WeGene的解读的话。可以直接把Fastq文件通过硬盘寄给我们。
 
自己做的话,一般可以参考GATK的best Practice。做QC,跑比对,cal变异,最后写点简单的脚本可以将其转化为rsid和AGCT的形式。
 
如果需要我们协助的话,请发邮件到service@wegene.com
wegene原始数据是什么格式?

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