关于原始数据，为啥友商同时提供bam和fq呢？

Fastq还没被map到人类参考基因组上，可以用bwa程序map到与build37或build38有关的坐标上，进而转化成bam。但要首先确认原数据的unmapped reads等信息是否被友商删除过

友商 实在. 给你原始的fastq reads, 和他们map的 bam 文件 还有 called variants.

fastq是原始数据 肯定好 但是有一说一 魔方高通的质量真的不行 太水

楼上23魔方有全基因测序？我这个友商40x的深度。

bam 是可以转回 fastq 的，而且上树只要 bam