Mehmet Mehmet - R1b-Z2106-CTS8966 综合讨论组

追踪武汉新型冠状病毒2019-nCov 的基因秘密,来看看自己的ACE2基因什么情况!

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疫疾无情,人间有情。武汉肺炎疫情形势严峻,在全国范围内,不仅仅是医护工作者在前线战斗,广大的科研工作者也在争分多秒地对2019-nCoV进行研究,希望尽快从根本上了解这一病毒并寻找战胜它的方法。
近日,同济大学附属东方医院的左为团队在 bioRxiv 上在线发表了一篇论文 Single-cell RNA expression profiling of ACE2,the putative receptor of Wuhan 2019-nCoV

该研究通过单细胞测序RNA-Seq技术发现:武汉新冠病毒(2019-nCoV)的受体ACE2在亚洲男性肺泡细胞中高表达!换句话说,仅从病毒受体方面分析,亚裔人群可能更容易感染武汉新冠病毒,尤其是亚裔男性。

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2019年12月,武汉华南海鲜市场爆发不明原因肺炎,经过病原体分离诊断及二代测序分析,该不明原因肺炎是由一种新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的。值得注意的是,2019-nCoV与SARS-CoV具有较高同源性,后续研究也证实两种病毒通过相同的受体入侵人体——血管紧张素转换酶2 (ACE2)

目前的统计数据表明2019-nCoV感染患者大多为亚裔男性,虽然这与病毒爆发的地区密切相关,但是2019-nCoV的受体ACE2作为一种基因的表达产物,是否在不同性别以及不同族裔人群中存在表达差异性,从而影响2019-nCoV乃至类似冠状病毒的易感性呢?在本研究中,研究人员通过单细胞RNA-Seq技术证实这一猜想。
 

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图为2019-nCoV的S-蛋白与人ACE2结合的预测模型

2019-nCoV的严重感染可导致急性呼吸窘迫综合征(ARDS)和败血症,最终导致患者死亡。先前的研究表明,2019-nCoV与人呼吸道接触后,病毒的刺突蛋白(spike protein)便与敏感细胞的表面受体ACE2结合,后者介导病毒进入靶细胞以进一步复制。尽管2019-nCoV与ACE2的结合强度弱于SARS-CoV,但仍远高于病毒感染所需的阈值。

受体的表达和分布决定了病毒感染的途径,而感染的途径对于理解发病机理和设计治疗策略具有重要意义。有研究表明ACE2主要在Ⅰ型和Ⅱ型肺泡上皮细胞(AT1和AT2)中表达。因此,研究者对在线数据库中的8名正常的肺移植捐献者的肺组织进行了单细胞RNA测序技术(scRNA-Seq)。他们分析了43134个细胞,并进行了聚类分析,又针对每个个体,基于标记基因而划分为8-11个不同的细胞簇。
 

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紧接着,研究者分析了ACE2在每个个体中的细胞类型特异性表达模式。对于所有供体,ACE2在所有人肺细胞中的表达率为0.64%,大多数ACE2表达细胞(平均83%)是AT2细胞(平均1.4±0.4%的AT2细胞表达ACE2)。其他表达ACE2的细胞类型包括AT1细胞、气道上皮细胞、成纤维细胞、内皮细胞和巨噬细胞。然而,它们表达ACE2的细胞比率较低,且在个体间存在差异。

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为了进一步了解表达ACE2的AT2特殊细胞群,研究者进行了基因本体富集分析,通过与不表达ACE2的AT2细胞进行比较,从而研究哪些生物学过程与该细胞群体有关。令人惊讶的是,多个病毒过程相关的生物学过程与之存在联系,包括“病毒过程的正向调节”(P值=0.001)、“病毒生命周期”(P值=0.005)、“病毒组装”(P值=0.03)以及“病毒基因组复制的正调节”(P值=0.04)。在ACE2表达的AT2中高度表达的病毒过程相关基因包括:SLC1A5、 CXADR和CAV2等34个基因。因此,2019-nCov似乎已经极其巧妙地进化到劫持AT2这一细胞群体,以便其复制和传播。
 
研究者进一步探究了供体特征及其ACE2的表达模式的关联性,但未检测到ACE2表达细胞数与捐献者年龄或吸烟状况之间的关联。

然而值得注意的是,2名男性供者的ACE2表达细胞比例高于其他6名女性供者(1.66% vs. 0.41%)。此外,ACE2在男性供者中的分布也比女性更广泛:男性肺中至少有5种不同类型的细胞表达ACE2受体,而女性肺中仅有2~4种。这一结果与疫情调查结果高度一致,调查显示,确诊的2019-nCov感染患者大多为男性。

研究人员还注意到,唯一的亚洲供体(男性)的ACE2表达细胞比率远高于白人和非裔美国人的供体(2.50% vs. 0.47% of all cells)。这也许可以解释为什么2019-nCoV大流行以及SARS-CoV大流行都集中在亚洲地区。

总而言之,该研究通过单细胞RNA测序技术以单细胞分辨率报道了ACE2在人肺中的RNA表达谱,并经过统计分析表明ACE2受体与性别和族裔相关。客观解释了当前2019-nCoV男性感染患者较多的临床统计数据,同时也解释了2019-nCoV在亚洲地区大流行的生物学原因。值得一提的是,该研究分析的样品过少,仍有待进一步研究确认。
 
以下是我几个样本的ACE2基因型:

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2020-02-01 • 南京, 江苏省, 中国
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5 个回复

rs2106809,rs2285666,我看也基本就这两个人和人之间会有差异,其他都一样啊。那么说了这么多,具体到每个,哪种组合才是危险,哪种是低风险?
zwh123 - 湖南洞口张姓
这篇文章是赤裸裸的昧着良心为了宣传基因助手消费没有基本鉴别能力吸引眼球的文章,实际上受检测的亚洲男性才一例,而且并没有写明到底是东亚裔、西亚裔、南亚裔、东南亚裔还是中亚裔,作者有可能故意隐瞒,也可能并不知道是哪个地区的亚裔,这些地区中大部分和中国人有者不同的人种,可以说论文就是来娱乐大众的,并非想有结论,一个不知道何来源的样本就拿出来炒作,是毫不严谨的,没有科研精神的!
怎么测?
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我也是这个,这是容易得还是不容易
这么说这次武汉肺炎是针对亚洲人的生化屠杀武器?

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