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ChinaMAP各省汉族聚类分析图

好像是比较新的论文图，缺少客家省导致广东广西的数据在图中显得突兀
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2020-05-06 • IP属地梅州
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13 个回复

havefun
微基因自己出的
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选了八个民族。

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为了不显得拥挤去掉了西北。

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2020-05-06 • IP属地梅州 • 评论 (0)
havefun
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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
havefun
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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
havefun
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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
havefun
早上看了一下原论文的图，发现岭南汉，即两广的数据很奇怪。图5b中壮族居然更接近南汉，反而是岭南汉十分另类。对比图5c，可以看出岭南汉和广东十分相似。但壮族却和广西差异十分之大，说明大多数壮族数据不是来自广西而是其他省份。
然后是各省数据量和人口关系成迷，上海一千九，浙江一千四，江苏却只有两百，安徽甚至是70，也许这造成了东部汉和中部汉和北方汉有较为清晰的分界线。南部汉族也迷，江西只有四十五，云南十一，重庆二十一，这与其说是南部汉，不如说是川湘贵汉。江西汉的数据量太低导致东南和岭南和南部之间出现了异常大的空白。同时广东汉取样地估计极其偏向粤西，导致广东数据东北部稀疏连接不上福建江西。

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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
havefun
图4c可以看出，广东的点和chs的点位置关系也很微妙，如果广东的取样没有偏向粤西，那似乎chs点的取样人群就是闽人，赣人，客人为主，和广府人没关联。如果广东的取样确实偏向了粤西，则说明chs取样人群为闽人，赣人，客人，以及珠三角的广府人，个人觉得这更为合理。

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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
[已注销]
瑞金医院牵头做的全基因组分析

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2020-05-07 • IP属地北京 • 评论 (16) • 发自微基因APP
havefun
再仔细看发现，由图4c的chd东南沿海人群，可以看出chs取样就是湘赣闽客以及珠三角的广府人。因为chd在接近最下方chs处是几乎没有的，反而在岭南汉附近有大量的点以及接近福建处有点，说明chd取得可能是闽浙人群。广东的闽人，主要为粤东的潮汕地区的潮汕人以及粤西的雷州半岛。这和chd在广东的分布一致。广东汉和广西汉聚类也说明岭南汉代表的其实是粤西汉。

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2020-05-07 • IP属地梅州 • 评论 (0)
执于卿 - 我的世界，只有你！
客家省？

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2020-05-08 • IP属地赣州 • 评论 (2) • 发自微基因APP
年轻的RORA基因
结果挺奇怪的，BMI的GWAS都没有重复出FTO基因

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2020-05-08 • IP属地深圳 • 评论 (0)
乡居村夫
专业！

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2020-05-08 • IP属地北京 • 评论 (0) • 发自微基因APP
havefun
我就是看到觉得奇怪，并不专业。还有不知道是我眼睛有问题，还是因为色彩对比导致(需要抓取颜色判断)，我在图4c里看到东部汉和北部汉有一堆灰色点，即壮族，如果说南部汉出现壮族还可以解释为父母中有一方是北方汉人，那这些出现在北方的点不知道怎么解释，总不能收集的是八分之一的壮族吧。而且从图5b看到壮族k8非常接近南部汉，从图4c可以看出灰点大量集中在右下方聚成一类，位于岭南汉正下方，远离南部汉。也就是壮族结果接近南部汉，完全是靠北边去拉起来的，而且从下方集中的灰色点数量，对比chs黑色点数量，发现这些聚集在下方的壮族点只占有不到总数一半的比例。画线连接两个聚集处，中点恰为chs最下方的黑点，即可能是珠三角广府人。也就是图5b的壮结果可能可以代表珠三角的广府人。

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2020-05-08 • IP属地梅州 • 评论 (0)
K2 - 炸号狂魔K2
不否认WGS的数据有几率找到很多可以把汉族人分开的SNP，从而让PCA这么好看
 
但奇怪的地方还是很多🐶

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2020-05-09 • IP属地深圳 • 评论 (0)

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