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发现一个不错的个人基因组工具网站:https://dnagenics.com/

刚刚看到有人在做各种个人基因组数据格式的转换比较,提到一个工具 DNA Kit Studio。就去查了一下这个工具的官方网站:https://dnagenics.com/
 
这网站上DNA Kit Studio还不是主打产品,作者开发了一个Admixture Studio的软件用来做各种常染色体的祖源分析,看上去用着挺方便的,内置的各种计算器也比较多。感觉项目祖源分析微解读的离线版,有兴趣的可以试试。
 
admixture:一般我们用来做常染色体祖源分析的算法被称为admixture算法——把各种族群混合的内容(mixture)分解(ad)出来:)
2020-08-26 • IP属地深圳
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11 个回复

王某 - 隔壁编号 F242-MF91-MF288
https://wgsextract.github.io/
感觉上这个工具对WGS更有可玩性
把samtools和yleaf之类的工具整合了一个桌面软件,一键模拟生成各种芯片文件
可惜只支持Dante Labs 和 Nebula Genomics 公司的文件
用微基因的bam尝试读取不了
不知道微基因有没有兴趣和他们对接一下,或者做一个自己的版本?
请问AS上计算器用的算法和微基因一样吗,都是admixture?
王某 - 隔壁编号 F242-MF91-MF288
因为是其他朋友的bam,具体不太清楚
只是给我发了这个
应该是卡这里了
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王某 - 隔壁编号 F242-MF91-MF288
他试了两次 好像都是这样
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Admixture上有没有推荐的计算器
yhlhhhhh - 每日与生物工程斗智斗勇到谢顶
ad st是真的挺好用,计算器多主要还能白嫖😏
加上他们新出的G25祖源分析工具,现在DNA Genics已经拥有了三大法宝:DNA Kit Studio、Admixture Studio、G25 Studio
为什么我登录不了?注册不了?怎么翻墙?
很耐斯
挺好用的,ad st
好工具

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