2016版的ISOGG Y树有修改

我今天发现2016版的ISOGG把我的父系祖源单倍体群的名称从O2b*改成了O1b2。请问WeGene的Y树也随着ISOGG进行更新吗?

另外,ISOGG将原来的O2b1*单倍体群的名称改成了O1b2a,并改用F3356突变(而不是原来的M312突变)来识别这个单倍体群。我在我的原始数据里发现我有F3356突变(rs13447440: A to T)。是不是我的父系祖源单倍体群应该为O1b2a?
2016-01-05 • IP属地美国
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3 个回复

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
1. ISOGG这次更新将之前O1和O2合并为现在的O1主要是因为通过全测序发现之前的O1和O2的关系更近。Y的命名中的单倍群名称比如O2b*...等是会不断变化,重要的还是看SNP位点;

2. WeGene的Y参考树也会随之更新;

3. 若你有F3356突变(rs13447440: A to T),那么检查过是否也有其他突变,譬如:F1204, F1290, F1530, F1805, F2634, F2960, F3147, F3327, F3356?这些F位点都是包含在WeGene检测中的,如果有更多平行位点也符合的话,那就可确信你属于这一单倍群。
@wang 谢谢你的回复。我的数据是从23andMe来的,但23andMe(v4)好像没检验除F3356以外的与O2b1*/O1b2a有关的其它突变。看来,没有更多的证据,只能靠F3356一个突变来估计了。WeGene的芯片检测这些突变吗?
 
最近发表的一遍有关O2b分支的文章建议用F3356突变来定义O2b1*/O1b2a单被群,作者似乎认为F3356+可作为一个充分条件。这也是你的理解吗?
 
http://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(15)30025-9/abstract
费力科思 - WeGene勤杂工
ISOGG这么快就到2016了~~~
 
ISOGG整棵树的抓取好麻烦啊

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