日本人父系中的O类型，可不可以理解为全部都是渡来人的后裔？

我觉得 应该把渡来时期加上具体的时间来考虑这个问题。
 
因为严格意义上讲，日本列岛上的所有 父系人群都是，从外面迁移而以来的。
 
加上个时间限制更好一些，比如2000年，3000年，4000年，5000年，10000年。
 
如果放在5000年这个时间考虑
 
我个人认为，O下面支系的主体应该还没进入日本列岛。
 
如果放在4000年前这个时间
 
O2a1b2a1-CTS445 的族群可能已经进入了日本列岛，也即是说绳文末期的父系类型，有O的可能性很高，除了
 
O2,也许还有O1b2-P49的某些支系。
 
C的话，必须分下游来看，绳文人中也许有C2北支的部分支系，
 
C2南支的话，基本都是晚近几千年来进入日本的，绳文人的可能性微乎其微。
 
C1a1的话，检测样本还是少，不太好说，现在日本人的主体的C1a1都是4000年内，
 
特别是最近2000年内强烈扩张的结果。而朝鲜半岛的C1a1人数虽然少，但是类型最丰富，日本的C1a1
 
是最近几千年内整体迁入日本列岛的可能性很大。

D系进入日本的途径，大概率就是步行，沿海岸线进入日本列岛，基本不可能是靠独木舟之类的。
看YFULL，日本的D系的扩张时间基本和日本列岛和大陆分离的时间一致，差不多就是和日本列岛分开后，D系才开始大规模的开枝散叶，之前一直是瓶颈。以两万年作为界限，2万年O，N应该已经到了环渤海，朝鲜半岛一代，进入日本也是大概率的事情。
就是和大陆分开，日本列岛也不是封闭的，进入日本的路径还是很多的，在日本8000年前长野县古人线粒体发现过大陆常见类型D4b2,说明那个时候已经有大陆族群进入日本。
现在日本的人，都是最近2000年渡来人群强烈扩张的结果，也许有些特有的O,N的下游支系，就是较早进入日本的这些族群的后代，不大规模测序根本发现不了。
现在日本列岛，朝鲜半岛古人测的还是太少了，Y的古样本基本没有，基本 都是靠
无论是哪个单倍群，无论是什么时期，从台湾方向向琉球，日本扩散的可能性微乎其微。
 


 
 

另外想请教您一个问题，您提到的日本的D系的扩张时间基本和日本列岛和大陆分离的时间一致，差不多就是和日本列岛分开后，D系才开始大规模的开枝散叶，之前一直是瓶颈，主要原因您觉得是什么呢？为什么列岛和大陆相连的时候D系的发展一直是瓶颈，分开以后就大规模开枝散叶了？除了巧合，有其他可能的原因吗？

其实日本D的扩张年代，和周围的其他单倍群C2北支，甚至N，差的不太大。
可能是那个时候东亚气候适合智人扩张吧。
我个人看法是，冰期不同的族群被隔离在不同的区域，冰期结束，各个单倍群的隔离被打破，向不同的区域扩张，而那个时候的东亚地广人稀，日本D系的竞争族群多向东亚其他位置更好的陆地方向扩张。
冰期结束，东亚北部，包括朝鲜半岛北部都挤满了其他强势族群，D系北上扩张无望，逐步退回日本列岛，也是有可能的。当然了这都没有什么太好的证据，完全是我个人的想象。

关于日语的源头，暂时有很多说法，没有什么定论。
但是日语肯定是渡来人群的语言，而不是绳文人的语言，这应该没有什么问题。
日语和朝鲜语像，主要是和汉语比较之后，觉得日语和朝鲜语接近。
如果把东亚的汉语去掉，你就发现，东亚北部的其他语言都差得不太多。
最近流行的一种说法，是日语的祖源语系，大概起源于中国黄海，渤海，朝鲜半岛内测的族群，也就是说所谓的 海之民。
我个人推测这个族群很可能和 O1b2-P49 的某些支系有关。

@深沉的Y染色体
阿伊努的父系数据不一定反应真实的情况，因为样本数太少了。
只测了两回，一共20个现代人样本。
 
縄文時代 前14000年頃 – 前10世紀，这个阶段的才叫绳文人，之前的叫旧石器时代古人。
前14000年頃 – 前10世紀绳这个给阶段的族群的父系肯定不是一种，除了D1a2a的某些支系以外，C2北支，C1a1的某些支系，N,O的某些支系，也都有可能。当然了D1a2a的某些支系，也许是弥生人也说不定，这种可能性不能排除。