将微基因给出的全序CRAM文件转为bam

软件：samtools, cmd(windows), 终端(Mac), terminal(Linux)
温馨提示：
1. 此转换过程时间很长，至少我的数据就花了4.5h，所以如果是晚上转换，建议大家洗洗睡吧
2. 一定要准备一个比较大的U盘，因为转换出来的文件大概90G
3. 电脑容易发烫的同学一定要找个方法降温
4. 记得电脑接电源
安装：
Windows：
官网直接下载链接：http://www.htslib.org/download/
利用wget下载命令：
wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.11/samtools-1.11.tar.bz2
Mac：
利用brew下载命令：brew install samtools
Linux：
没试过，不知道23333
 
转换：
1. 下载参考序列：human_g1k_v37
2. 打开终端，输入命令：cd 你存储cram文件的文件夹路径
3. 之后输入命令：samtools view -T human_g1k_v37.fasta -b input.cram > output.bam
4. 等着吧