各种免费hla分型软件尝试总结

hla分型，最好是50x深度以上的测序，100x更好。30x以下就别玩了。

软件来说，最好准确性的目前是hlahd，在100x深度下，6位hla分型准确率100%，50x下超过99%。

其他几个，你就别用了，准确率在50x深度下，4位分型准确率低于90%，包括hlascan(虽然速度快，准确率一坨屎)，optitype，xhla，等等。

histat2genotype准确率也可以，略微差一点。