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商冠东
综合讨论组
对于一个想学习生物信息学的人来说,Wegene提供给我的自己的SNP文件有什么用么
求助各位大神,我想利用Wegene给我的原始数据,来学习些生信分析。。。不知道这个能怎么开展
2017-06-27 • IP属地南京
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费力科思
-
WeGene勤杂工
可以考虑做这么几个事情:
1. 用千人基因组的数据,选择自己感兴趣的人群,构建一个训练数据集,用Admixure软件做一个自己的祖源成分分析;这个过程中你会熟悉千人基因组数据集,如何处理NGS的VCF文件,如何抽取和组合数据,如何使用Admixture软件等等。
2. 用Clinvar数据库注释你自己的所有SNP。这个过程你需要自己写一些脚本,熟悉Clinvar数据库,知道各种突变的描述方式,知道疾病相关位点的分类和表达方式等等。
。。。
最近发现一本书,叫exploering peronal genomics,序言是Church大神写的,专门教你怎么玩个人基因组数据,可以看看。
如果全部折腾明白了,请发简历给我,recruit@wegene.com
zhengqiang
-
勤奋学习
来了就能升级wgs数据,然后继续学习。
bunnyfz
-
O1a1b
F2911你好。怎么不加Q群呢?群里有专家
bunnyfz
-
O1a1b
O1a内部交流群群号;490879081。报是微基因的O1a.就可以了。
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商冠东
综合讨论组
8049 个讨论
4 个回复
1. 用千人基因组的数据,选择自己感兴趣的人群,构建一个训练数据集,用Admixure软件做一个自己的祖源成分分析;这个过程中你会熟悉千人基因组数据集,如何处理NGS的VCF文件,如何抽取和组合数据,如何使用Admixture软件等等。
2. 用Clinvar数据库注释你自己的所有SNP。这个过程你需要自己写一些脚本,熟悉Clinvar数据库,知道各种突变的描述方式,知道疾病相关位点的分类和表达方式等等。
。。。
最近发现一本书,叫exploering peronal genomics,序言是Church大神写的,专门教你怎么玩个人基因组数据,可以看看。
如果全部折腾明白了,请发简历给我,recruit@wegene.com
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