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为什么有很多位点未检出?


比如头发卷曲还是直,rs1454292 rs3124314 rs6732426 rs7349332这些位点未检出,一共7个,只检出3个,给出了直发的结果。
但是我明显是卷发。
还有很多位点同样未检出。希望报告能给出一个检出的比例。
2016-01-29 • IP属地济南
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8 个回复

zhengqiang - 勤奋学习
1,我们解读数据库和芯片设计是分开的,解读数据库不断在更新,所以导致部分更新的数据不一定在我们芯片上。
2,确实我们芯片也有未检测率,一般来说call rate基本上都是在99%以上。
3,部分SNPs在芯片上无法检出。
@马丰收 头发卷曲选用的位点全是基于欧洲人群的研究结果,对东亚人的区分度不是很好。接下来我们得进行大量的问卷调查,结合其全基因组芯片数据,分析符合东亚人群的位点,使预测更加准确。
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卷发照片

卷发.jpg

 
另外,除了头发卷曲,还有黄色深红色头发,应该是遗传自我母亲一方。我母亲的兄弟姐妹都是头发都偏黄,高鼻梁,瞳孔的颜色也偏黄。听我妈说老爷的父亲从西北逃难来到山东。
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
求楼主贴照片,看下头发卷曲程度~
我个人理解的是:一些位点来源文献的解读和数据库,可能不在芯片设计上,另外可能就是在检测时未能对应上,所以显示未检出,不过考虑到可能不影响中国人群结果的判断和解读,以及所占比重可能不大的情况下,在未检出该部分位点的情况下,也可以生成报告,而至于卷发和直发的判断,比较直观,很多因素可能会影响到判断。
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看到什么值得买上面有人晒单 同样也是卷发测出来是直发
http://test.smzdm.com/pingce/p/28962/
未检测和没测这位点应该区分
根据下载数据来看,我的未检出位点有7025个,总位点数596744,未检出率大概1.18%。 这是不是有点高了?

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