WeGene Y单倍群计算方式和参考数据集

WeGene的Y单倍群计算最开始是简单的自研算法。@wang 传超同学加入后，建议我们参考学术界的算法并加以优化改进。
 
现在WeGene所使用的Y单倍群算法的主要参考文献是BMC Genomics上的这篇AMY-Tree，链接：http://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-14-101
 
AMY-Tree算法原本是针对全基因组测序数据设计的，所以我们重新用Python实现了算法，并根据芯片数据的特点进行了优化和调整。正在整理论文和测试数据，尽快发布给大家。有时间会整理成一个单独的开源程序放到github上。
 
所使用的数据是源自AMY-Tree 2.0中所提供的2.1版的数据，这是2014年3月的数据。我们根据芯片对突变位点覆盖情况以及考虑到我们的用户主要是东亚人群，对数据做了清理。
 
原AMY-Tree程序和数据下载地址：https://bio.kuleuven.be/eeb/lbeg/software