annabelle39 annabelle39 祖源分析

关于23ndme 和 wegene 组源比对,求帮忙看下

有个疑问,23nd me 中,祖源说我19%韩国人,导入wegene 是10%多的日本人。而且关于蒙古语系这边 23nd me 显示的范围包括哈萨克斯坦等中亚国家,wegene就是蒙古地区?
2018-07-11 • IP属地美国
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10 个回复

从我读到的材料看,23andMe和WeGene在测祖源的方法上有相当大的区别。
  1. 23andMe分析祖源时是将染色体分成段来看,每段为100个连续的标记(位点),计算每段与哪个祖源最接近,而且其分段的长度能让23andMe称其分析是注重顾客近500年的祖源。WeGene看来不分段,只看位点,不好估算祖源的年限。
  2. 23andMe试图将从父母继承下来的两条染色体分开看,但WeGene看来是是把两条染色体的位点混在一起看。尽管在没有父母样本的情况下试图区分两条染侧体容易分错,但还是比混在一起看算出的结果更准确。分析祖源时若不区分两条染色体就容易把父母的两个不同的祖源(如雅库特和傣族)合成介乎于两者之间的第三种祖源(如北汉或南汉)。
  3.  尽管两家都用了HGDP的数据,但23andMe补充了自己搜集的数据(如其蒙古参考人群数据除来源于HGDP外还包括从蒙古国得到的样本)。同时,两家从HGDP选的具体样本很可能也不尽一样。23andMe最新版本的芯片V5能给来自韩国的顾客很高的韩国祖源(80%-95%),也能给来自蒙古国的顾客较高的蒙古祖源(50%-80%),显然其算法的区分能力已相当强。
  4. 目前23andMe东亚的参考人群比WeGene少得多,虽然分类比较粗,但也减少了出错的机会。不过,23andMe正在推出新的一代祖源分析,包括很多新的东亚参考人群(如傣族、越南、菲律宾和印尼等)。
 
* 后为@蓝星旗补充了三个23andMe的祖源分析
Mongolian 62.9%
Yakut 9.2%
Chinese 2.9%
Korean 1.2%
Japanese 0.4%
Broadly East Asian 8.3%
Native American 0.1%
Southeast Asian 0.1%
Broadly East Asian & Native American 0.7%
Broadly Southern European 0.7%
Broadly Northwestern European 0.5%
Eastern European 0.4%
Broadly European 4.3%
Broadly South Asian 2.0%
Middle Eastern 1.0%
Northern African 0.1%
Unassigned 5.4% 

Mongolian2.png


Mongolian3.png

 
其实我觉得微基因比23andMe的蒙古高还是比较好理解的。毕竟微基因的取样地在内蒙,内蒙人肯定有更多接近汉族成份。23andMe的取样地应该在蒙古国。
我相反,在23andMe有少量蒙古,在微基因是零哈哈
我是微基因55%的蒙古,23魔方是0
你试试E11呢
我是wegene 30.37%蒙古语系, 23andme 19.1% Manchurian&Mongolian 
wegene 没有韩国,23andme 7.2% Korean (South Korean)
可能是定义和算法差异的共同影响了,另外就是北方民族的复杂性了,蒙古本身就是无数草原部落合体,日韩是o本来就是大陆过去的。共祖的部分标记给谁都可。
23andme 说我是18%韩国人和10%满蒙,但是wegene上是21%蒙古,没有韩国……dna land的结果是19%蒙古/突厥

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